Κύριος στόχος του Συμφώνου, όπως τόνισαν και οι δύο πλευρές, είναι η κοινή έρευνα στους τομείς της εξωτερικής πολιτικής, των διεθνών σχέσεων, του διεθνούς δικαίου και του περιβάλλοντος, καθώς και η εποικοδομητική συνεργασία για την προώθηση δημοσιεύσεων και τη διοργάνωση εκδηλώσεων.
Η ερευνητική συνεργασία είναι ιδιαίτερα σημαντική στους τομείς του περιβάλλοντος, της αντιμετώπισης των κλιματικών αλλαγών, της καινοτομίας και της ενέργειας. Οι επιστημονικές συνέργειες δημιουργούν περιβάλλον για διακρατικές συνεργασίες, συμβάλλουν στην ανάπτυξη και δημιουργούν θέσεις εργασίας.
Η πρωτοβουλία αυτή και οι κοινές επιστημονικές προσπάθειες των δύο ινστιτούτων, που έχουν εργαστεί επί μακρόν σε αυτούς τους τομείς, τόσο στην Ελλάδα όσο και διεθνώς, στόχο έχουν να ενισχύσουν τους δεσμούς καλής γειτονίας, αντιμετωπίζοντας κοινά προβλήματα και σύγχρονες προκλήσεις με τα κράτη της νοτιοανατολικής Ευρώπης και της Μαύρης Θάλασσας, αλλά και να ενισχύσουν το ρόλο της Ελλάδας.
